MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	CAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007506	GCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007506	GACC	2	8	188	195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007506	GCC	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007506	C	7	7	270	276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_007506	ACT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007506	AGC	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007506	CAAT	2	8	375	382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007506	CCGC	2	8	432	439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007506	TGC	2	6	475	480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007506	GT	3	6	495	500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007506	GCA	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007506	CGC	2	6	646	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007506	CAA	2	6	692	697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007506	GGC	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007506	CAC	2	6	764	769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007506	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007506	GC	3	6	902	907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007506	CCG	2	6	917	922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007506	GCCAG	5	25	941	965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007506	G	6	6	992	997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007506	CTG	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007506	GCT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007506	CGAAAA	2	12	1055	1066	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007506	A	6	6	1063	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007506	GGC	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007506	TCA	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007506	CCG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007506	ACC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007506	CGC	2	6	2077	2082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007506	GTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007506	CAG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007506	CAG	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007506	CGC	3	9	2330	2338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007506	AAACC	2	10	2418	2427	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007506	GCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007506	CCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007506	CAA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007506	CAG	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007506	GGT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007506	CCG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007506	ATG	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007506	GTAT	2	8	3498	3505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007506	CTAT	2	8	4468	4475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007506	TA	3	6	4477	4482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007506	GCAGC	2	10	4494	4503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007506	TA	5	10	4554	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007506	CCTA	2	8	4564	4571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007506	GCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007506	CCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007506	GCCGC	2	10	5622	5631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007506	ATC	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007506	TTTG	2	8	5677	5684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007506	AAAC	2	8	5742	5749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007506	TAG	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007506	AGC	2	6	7058	7063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007506	GCG	2	6	7064	7069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007506	CAGG	2	8	7113	7120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007506	AAC	2	6	8416	8421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007506	TCAA	2	8	8422	8429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007506	AT	3	6	8484	8489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007506	CCT	2	6	9177	9182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007506	AAC	2	6	9189	9194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007506	CAT	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007506	C	6	6	9255	9260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_007506	GAG	2	6	9307	9312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007506	CGT	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007506	GGT	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007506	GAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007506	AGG	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007506	TA	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007506	CAG	2	6	12374	12379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007506	AGG	2	6	12386	12391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007506	GCG	2	6	13022	13027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007506	GGGCC	2	10	16105	16114	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007506	CGT	2	6	19148	19153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007506	TGC	2	6	20457	20462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007506	CTT	2	6	20586	20591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007506	CGC	2	6	20604	20609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007506	GC	3	6	20689	20694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007506	TTC	2	6	20710	20715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007506	TG	3	6	20721	20726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007506	ACC	2	6	21339	21344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007506	CTT	2	6	21940	21945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007506	CGCA	2	8	27918	27925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007506	TCA	2	6	28017	28022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007506	AAC	2	6	28051	28056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007506	CT	3	6	33127	33132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007506	T	9	9	33179	33187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007506	CAA	2	6	33257	33262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007506	ATT	2	6	33301	33306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007506	CGA	2	6	34359	34364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007506	ATG	2	6	37109	37114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007506	CAG	2	6	37156	37161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007506	CCG	2	6	37179	37184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007506	CCA	2	6	37263	37268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007506	CGA	2	6	37290	37295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007506	CTC	2	6	37321	37326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007506	G	7	7	38088	38094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007506	TG	3	6	38101	38106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.